जनवरी 2006 में, इस्लामवादी अर्धसैनिक तालिबान के खिलाफ लड़ाई में अमेरिका और ब्रिटेन की सेना की सहायता के लिए अफगानिस्तान में अंतर्राष्ट्रीय सुरक्षा सहायता बल (आईएसएएफ) को तैनात किया गया था। अमेरिकी सरकार ने तालिबान पर अल-कायदा के सरगना ओसामा बिन लादेन को पनाह देने का आरोप लगाया और उसके प्रत्यर्पण की मांग की। तालिबान नेतृत्व ने इस मांग का पालन करने से इनकार करते हुए कहा कि संयुक्त राज्य अमेरिका ने 9/11/2001 के हमलों में ओसामा के अपराध का सबूत नहीं दिया।
2001 के अंत तक, तालिबान का सैन्य ढांचा व्यावहारिक रूप से नष्ट हो गया था, और उसके समर्थकों के प्रतिरोध ने गुरिल्ला आंदोलन का रूप ले लिया था। पश्चिमी देशों ने लोकतंत्र के विकास और अफगानिस्तान के सामाजिक ढांचे में भारी निवेश किया है। 2004 में, देश का पहला राष्ट्रपति चुनाव हामिद करजई द्वारा जीता गया था, जो एक राजनेता है जो पश्चिम के प्रति काफी वफादार है। हालांकि, तालिबान समर्थकों के प्रतिरोध को दबाने में विफल रहा। ISAF की भारी सैन्य श्रेष्ठता के बावजूद गुरिल्लाओं ने जमकर लड़ाई लड़ी।
फ्रांस, गठबंधन के अन्य सदस्यों की तरह, उपकरण और जनशक्ति में नुकसान उठाना पड़ा। अफगानिस्तान में युद्ध के 10 वर्षों के दौरान, 83 सैनिक मारे गए और कई गुना अधिक घायल हुए। फ़्रांस को सैन्य अभियान में शामिल करने का निर्णय आबादी के बीच बहुत लोकप्रिय नहीं था, और फ्रांसीसी सैनिकों के हताहत होने की रिपोर्ट से सरकार के प्रति असंतोष बढ़ गया।
20 जनवरी 2012 को, कपिसा प्रांत में, एक अफगान सेना की वर्दी में एक व्यक्ति ने 4 को गोली मार दी और 16 फ्रांसीसी सैनिकों को घायल कर दिया। उसके बाद, निकोलस सरकोजी (2007 से 2012 तक फ्रांसीसी राष्ट्रपति) ने कहा कि चूंकि अफगान सरकार फ्रांसीसी सैनिकों की सुरक्षा की गारंटी नहीं दे सकती है, इसलिए फ्रांस उस देश में अपनी सैन्य उपस्थिति को निलंबित कर रहा है। सरकोजी ने 2014 की शुरुआत में अफगानिस्तान से सैनिकों को वापस बुलाने का वादा किया था।
2012 में, फ्रांस्वा ओलांद फ्रांस के राष्ट्रपति चुने गए, जिन्होंने अफगानिस्तान से हटने की एक नई योजना की घोषणा की। 2012 के अंत तक 2,000 सैनिकों को वापस ले लिया जाएगा, 1,400 प्रशिक्षकों के रूप में बने रहेंगे और सामाजिक सुविधाओं की रक्षा करेंगे। राष्ट्रपति ने अपने निर्णय की व्याख्या इस तथ्य से की कि आतंकवादियों से खतरा कम हो गया है, लोकतंत्र मजबूत हो गया है, और देश को स्वतंत्र रूप से विकसित होना चाहिए। गणतंत्र के प्रमुख ने वादा किया कि फ्रांस अफगानिस्तान का समर्थन करना जारी रखेगा, लेकिन एक अलग रूप में।